| アイテムタイプ |
学術雑誌論文 / Journal Article(1) |
| 公開日 |
2025-09-24 |
| タイトル |
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タイトル |
AFM observation of protein translocation mediated by one unit of SecYEG-SecA complex |
| 言語 |
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言語 |
eng |
| キーワード |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
Atomic force microscopy |
| キーワード |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
Bacterial secretion |
| キーワード |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
Protein translocation |
| 資源タイプ |
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資源タイプ |
journal article |
| アクセス権 |
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アクセス権 |
open access |
| 著者 |
Kanaoka, Yui
Mori, Takaharu
Nagaike, Wataru
Itaya, Seira
Nonaka, Yuto
甲賀, 栄貴
Haruyama, Takamitsu
Sugano, Yasunori
宮﨑, 亮次
Ichikawa, Muneyoshi
Uchihashi, Takayuki
塚崎, 智也
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| 抄録 |
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内容記述タイプ |
Abstract |
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内容記述 |
Protein translocation across cellular membranes is an essential and nano-scale dynamic process. In the bacterial cytoplasmic membrane, the core proteins in this process are a membrane protein complex, SecYEG, corresponding to the eukaryotic Sec61 complex, and a cytoplasmic protein, SecA ATPase. Despite more than three decades of extensive research on Sec proteins, from genetic experiments to cutting-edge single-molecule analyses, no study has visually demonstrated protein translocation. Here, we visualize the translocation, via one unit of a SecYEG-SecA-embedded nanodisc, of an unfolded substrate protein by high-speed atomic force microscopy (HS-AFM). Additionally, the uniform unidirectional distribution of nanodiscs on a mica substrate enables the HS-AFM image data analysis, revealing dynamic structural changes in the polypeptide-crosslinking domain of SecA between wide-open and closed states depending on nucleotides. The nanodisc-AFM approach will allow us to execute detailed analyses of Sec proteins as well as visualize nano-scale events of other membrane proteins. |
| 書誌情報 |
en : Nature Communications
巻 16,
号 1,
ページ数 12,
発行日 2025-01-08
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| 出版者 |
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出版者 |
Nature Research |
| ISSN |
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収録物識別子タイプ |
EISSN |
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収録物識別子 |
2041-1723 |
| 出版者版DOI |
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関連タイプ |
isReplacedBy |
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識別子タイプ |
DOI |
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関連識別子 |
https://doi.org/10.1038/s41467-024-54875-x |
| 出版者版URI |
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関連タイプ |
isReplacedBy |
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識別子タイプ |
URI |
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関連識別子 |
https://www.nature.com/articles/s41467-024-54875-x |
| 権利 |
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権利情報Resource |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ |
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権利情報 |
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| 著者版フラグ |
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出版タイプ |
NA |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP21H05157 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PLANNED-21H05157/ |
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研究課題名 |
ベイズ統計学を組み入れた次世代構造モデリングプラットフォームの構築と応用 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP24K03035 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24K03035/ |
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研究課題名 |
MD計算と機械学習による高速AFM像中のタンパク質の状態解析 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP23K14146 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K14146/ |
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研究課題名 |
ファージ由来の抗菌ペプチドの細胞壁合成阻害機構の解明 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP22K15075 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15075/ |
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研究課題名 |
軸糸構造を模倣したダイニン・微小管の改変技術の開発 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP20K15733 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20K15733/ |
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研究課題名 |
生体内に近いダブレット微小管の原子モデルの構築 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP22K15061 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15061/ |
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研究課題名 |
生細胞内での膜透過途上の新生ポリペプチド鎖の相互作用動態解析 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP22H05567 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PUBLICLY-22H05567/ |
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研究課題名 |
特殊な硫黄間相互作用が要となる新奇チオ硫酸トランスポーターの解析 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP21H000393 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP24K01309 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24K01309/ |
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研究課題名 |
高速AFMで明らかにする一分子局所力学物性のダイナミクスと機能相関 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP22H02567 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K23831/ |
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研究課題名 |
膜タンパク質のバイオジェネシスに関わる糖脂質MPIaseの構造と機能に関する研究 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP22H02586 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23K23850/ |
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研究課題名 |
ホロトランスロコン複合体による効率的タンパク質分泌の構造基盤 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP21H05155 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PLANNED-21H05155/ |
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研究課題名 |
タンパク質の膜透過システムの４次元ダイナミクスとアッセンブリ |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP21H05153 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-ORGANIZER-21H05153/ |
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研究課題名 |
メガダルトン生命機能深化ダイナミクス |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP21K19226 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19226/ |
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研究課題名 |
タンパク質膜透過駆動モーター SecA ATPase の駆動力を測定する |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS) |
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研究課題番号 |
JP21KK0125 |
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研究課題番号URI |
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21KK0125/ |
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研究課題名 |
統合的構造解析法による繊毛中心対複合体の構造解明 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Science and Technology Agency (JST) |
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研究課題番号 |
JPMJPR20E1 |
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研究課題番号URI |
https://projectdb.jst.go.jp/grant/JST-PROJECT-20345003/ |
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研究課題名 |
繊毛の運動機構の原子レベルでの解明 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Japan Science and Technology Agency (JST) |
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研究課題番号 |
JPMJKP23H2 |
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研究課題番号URI |
https://projectdb.jst.go.jp/grant/JST-PROJECT-23830309/ |
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研究課題名 |
トランスロコン型ナノポア計測法による１分子ペプチドシークエンサーの開発 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT) |
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研究課題番号 |
JPMXP1020230119 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT) |
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研究課題番号 |
hp230209 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT) |
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研究課題番号 |
hp240215 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT) |
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研究課題番号 |
hp240277 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT) |
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研究課題番号 |
JPMXP1323015482 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Natural Science Foundation of Shanghai |
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研究課題番号 |
24ZR1403800 |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
The Chemo-Sero-Therapeutic Research Institute |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Naito Foundation |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Takeda Science Foundation |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Institute for Fermentation (Osaka) |
| 助成情報 |
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助成機関名 |
Yamada Science Foundation |
